Заедно с развитието на науката, редица теории по отношение на атома са разработени от учени. Един от тях е J.J Thomson, чиято теория е по-известна като атомната теория на Thomson. В предишната дискусия обсъдихме значението на атомите. Където атомите са най-малките частици от даден елемент, които участват в химични реакции. Тяхният много малък размер ги прави невидими, дори използвайки най-силните светлинни микроскопи. Най-малкият атом е атомът във водорода.
През 1897 г., използвайки метода на електронно-лъчевата тръба, изобретен по-рано от Майкъл Фарадей (1791-1867), Томсън определя съотношението на масата (m) към електрическия заряд (e) за катодни лъчи. Въз основа на съотношението м/д Този Томсън заключава, че катодните лъчи са отрицателно заредените елементарни частици от подреждането на атома.
Катодните лъчи стават известни като електрони, термин, предложен за пръв път от Джордж Стоуни през 1874 г. Моделът на атомната теория на Томсън е известен също като модел на диня или слива, тъй като електроните в сферата на положителния заряд са същите като сушените плодове в кръглия коледен пудинг или по-известен като теория за стафидовия хляб.
(Прочетете също: Atom Models, What Are You?)
Атомната теория на Томсън заключава, че атомът е масивна или твърда топка с положителен заряд. При което атомът се състои от положително заредена топка и вградени в нея електрони. Освен това той твърди, че атомът е неутрален, тъй като има отрицателен и положителен заряд в една и съща величина.
Моделът на атомната теория на Томсън обаче е краткотраен. След публикуването му за около 10 години, слабостта на тази теория започна да се проявява. Тази теория се счита за неспособна да обясни динамиката на химичните реакции, които протичат между атомите. Всъщност несъвършенството на атомната теория на Томсън е посочено от един от учениците на Томсън на име Ърнест Ръдърфорд.
Някои от въпросните слабости са, не могат да обяснят феномена на разсейване на алфа частици от тънката златна мембрана, предложен от Ръдърфорд, и не могат да обяснят съществуването на атомно ядро.