Заедно с развитието на науката, редица теории относно атома са разработени от учени и са повлияли на човешката цивилизация, особено донасяйки напредък в областите на физиката, химията и биологията. С развитието на науката за атомите можем да разберем как подреждането на атомите или как атомите реагират помежду си, за да образуват връзка.
Един от учените, разработили атомния модел от предишни учени, е Ърнест Ръдърфорд (1911), известен като атомната теория на Ръдърфорд. В тази атомна теория Ръдърфорд казва, че атомът има централно ядро или често наричан неклеус, заобиколен от облак от отрицателно заредени електрони. Атомната теория на Ръдърфорд се основава на експерименти чрез изстрелване на тънък слой (фолио) от злато с помощта на алфа (а) частици.
Преди това са били открити алфа частици, които са частици с положителен заряд и се движат направо, имайки голямо проникване, за да могат да проникнат през тънки листове хартия. Експериментът всъщност има за цел да провери мнението на J.J Thomson относно това дали атомът наистина е твърда, положителна топка и когато е изложен на алфа частици, той ще бъде отражен или отклонен.
От наблюденията на Ръдърфорд е установено, че повечето от алфа частиците преминават през златното фолио, без да се огъват, където по-голямата част от пространството в атома е празно. Освен това много малко частици са отклонени от пътя си, т.е.положителният заряд на атома заема много малко място. Когато минималната част на -α частицата се отклони до 1800 г., т.е. целият положителен заряд и атомната маса на златото се концентрира в много малък обем вътре в атома, който се нарича ядро.
(Прочетете също: Запознаване с атомната теория на Томсън)
Предимствата на атомната теория на Ръдърфорд, наред с други, са лесни за разбиране, за да се обясни много сложната атомна структура, може да се обясни формата на електронна траектория около атомното ядро и да се опише движението на електроните около ядрото.
За съжаление атомната теория на Ръдърфорд има много слабости, сред които тази теория не може да обясни стабилността на атома. Съгласно законите на електродинамиката, електроните трябва да излъчват електромагнитни вълни в резултат на радиация. Енергията на електрона трябва да се намалява непрекъснато и траекторията на електрона се превръща в спирала, която го отвежда до ядрото и в резултат на това атомът трябва да се срути, но това изобщо не се случва.
Друга слабост е, че атомната теория на Ръдърфорд не обяснява стабилността на атома. Където въртящите се електрони ще загубят енергия и в крайна сметка ще попаднат в ядрото, където това не е възможно.
